Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RfxankQ9Z205 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms