Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Nme3Q9WV85 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Nme3Q9WV85 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Nme3Q9WV85 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Nme3Q9WV85 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Nme3Q9WV85 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Nme3Q9WV85 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Nme3Q9WV85 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Nme3Q9WV85 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Nme3Q9WV85 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nme3Q9WV85 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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