Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms