Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC3

Bhlha15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha15Q9QYC3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlha15Q9QYC3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms