Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Crlf1Q9JM58 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Crlf1Q9JM58 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Crlf1Q9JM58 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Crlf1Q9JM58 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Crlf1Q9JM58 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Crlf1Q9JM58 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Crlf1Q9JM58 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Crlf1Q9JM58 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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