Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms