Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms