Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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