Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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Rb1cc1Q9ESK9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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