Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DysfQ9ESD7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms