Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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