Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms