Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf6Q9DBU5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf6Q9DBU5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf6Q9DBU5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf6Q9DBU5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf6Q9DBU5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf6Q9DBU5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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