Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm29188-201ENSMUST00000191173 767 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Shisa5-204ENSMUST00000196954 843 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Mfap5-201ENSMUST00000032210 946 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr979-201ENSMUST00000080835 1045 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm12479-201ENSMUST00000120731 1585 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms