Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Med29Q9DB91 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms