Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms