Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms