Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rnf138rt1Q9D9M9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf138rt1Q9D9M9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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