Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms