Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms