Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms