Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ttc9bQ9D6E4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms