Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx29Q9D3S3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms