Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rufy3Q9D394 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy3Q9D394 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rufy3Q9D394 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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