Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms