Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.2 ms