Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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