Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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