Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Q9CWU4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CWU4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms