Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms