Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms