Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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