Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ergic3Q9CQE7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ergic3Q9CQE7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ergic3Q9CQE7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms