Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Pole4Q9CQ36 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pole4Q9CQ36 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms