Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim26Q99PN3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms