Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms