Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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