Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms