Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rcbtb2Q99LJ7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms