Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp5lQ99LH9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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