Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms