Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms