Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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