Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Letmd1Q924L1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms