Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms