Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klhdc3Q8VEM9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms