Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms