Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Prpf39Q8K2Z2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Prpf39Q8K2Z2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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