Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf628Q8CJ78 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Znf628Q8CJ78 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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