Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms